Разработан алгоритм поиска потенциальных терапевтических целей по всему геному человека

Исследователи из Технологического института Нью-Джерси и Детской больницы Филадельфии разработали алгоритм, который вычисляет участки метилирования ДНК - процесса, который может изменить активность ДНК без изменения ее общей структуры.

Метилирование ДНК участвует во многих ключевых клеточных процессах и является важным компонентом экспрессии генов. Ошибки метилирования связаны с множеством заболеваний человека. При этом традиционные инструменты геномного секвенирования не могут уловить эффекты метилирования.

По словам исследователей это определяется тем, что методы, разработанные для определения сайтов метилирования в геноме, могли видеть только нуклеотиды определённой длинны в данный момент времени, поэтому большое количество сайтов метилирования было упущено.

Хакон Хаконарсон, директор Центра прикладной геномики Детской больницы и ведущий автор исследования пояснил, что его команда применила при разработке алгоритма машинное обучение при поддержке суперкомпьютеров Национального научного фонда США в рамках проекта XSEDE. В результате им удалось создать инструмент, который идентифицирует подозрительные участки по всему геному.